L'AFJ a trois missions principales :

Accueil : Aider à l'adaptation et l'intégration des Français nouveaux arrivants au Japon, grâce à son service JAPON ACCUEIL. Cette aide se veut un complément des services officiels des Consulats de France au Japon et inclut l'édition d'un guide d'accueil ainsi que le relais de correspondants bénévoles locaux d'accueil de proximité à travers le Japon. Plus d'information ici: Mission d'Accueil.

Convivialité : Animer la communauté francophone du Japon (Français, Japonais et autres), via l'organisation d’activités et manifestations conviviales ouvertes à tous (avec des conditions préférentielles pour les membres cotisants), notamment dans neuf domaines d’activités artistiques, culturelles, festives, gastronomiques, jeunes, ludiques, nature sportives et touristique . Plus d'information ici: Mission de Convivialité.
L'AFJ œuvre en particulier au renforcement des relations d'amitié franco-japonaise, par son appartenance au reseau culturel français au Japon coordonné par le service culturel de l'Ambassade de France et par ses relations privilégiées avec les nombreuses sociétés et associations franco-japonaises thématiques ou régionales.

Solidarité : Aider les Français du Japon en difficulté, notamment sous forme d'aides financières ou de prêt d'honneur grâce à une caisse de secours des Français du Japon, alimentée par la générosité des adhérents et des bienfaiteurs de l'AFJ. Cette aide est offerte en complément et sur recommandation des Comités Consulaires, où siège un répresentant de l'AFJ. Plus d'information ici: Mission de Solidarité.

Secteur d'activité : Association de quartier ou locale, amicale ou groupement de personnes originaires d’une même région ou d’un même pays